A través de la mayor parte de su trabajo en Enterprise Architect, cualquier cambio que realice se guarda automáticamente cuando cierra la ventana (ventana de entrada de datos) en la cual realiza los cambios. En algunos casos la ventana contiene el botón Guardar, el cual le permite guardar los cambios y luego seguir trabajando en la ventana.

Si no hay una ventana específica, como cuando crea un diagrama, puede guardar su trabajo presionando las teclas [Ctrl]+[S], o seleccionado la opción de menú Diagrama | Guardar.

A menudo, Enterprise Architect no permite cerrar un pantalla sin confirmar que quiere guardar o descartar sus cambios.